Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IRGMA1A4Y4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRGMA1A4Y4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRGMA1A4Y4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRGMA1A4Y4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRGMA1A4Y4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRGMA1A4Y4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRGMA1A4Y4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRGMA1A4Y4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRGMA1A4Y4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRGMA1A4Y4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRGMA1A4Y4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRGMA1A4Y4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IRGMA1A4Y4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRGMA1A4Y4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRGMA1A4Y4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRGMA1A4Y4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRGMA1A4Y4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRGMA1A4Y4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRGMA1A4Y4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRGMA1A4Y4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRGMA1A4Y4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRGMA1A4Y4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRGMA1A4Y4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRGMA1A4Y4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRGMA1A4Y4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRGMA1A4Y4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRGMA1A4Y4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRGMA1A4Y4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRGMA1A4Y4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRGMA1A4Y4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRGMA1A4Y4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRGMA1A4Y4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRGMA1A4Y4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRGMA1A4Y4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
IRGMA1A4Y4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRGMA1A4Y4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRGMA1A4Y4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRGMA1A4Y4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRGMA1A4Y4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRGMA1A4Y4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRGMA1A4Y4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRGMA1A4Y4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRGMA1A4Y4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IRGMA1A4Y4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRGMA1A4Y4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRGMA1A4Y4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IRGMA1A4Y4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRGMA1A4Y4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRGMA1A4Y4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRGMA1A4Y4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRGMA1A4Y4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRGMA1A4Y4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRGMA1A4Y4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRGMA1A4Y4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRGMA1A4Y4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRGMA1A4Y4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRGMA1A4Y4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRGMA1A4Y4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRGMA1A4Y4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRGMA1A4Y4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRGMA1A4Y4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRGMA1A4Y4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRGMA1A4Y4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRGMA1A4Y4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRGMA1A4Y4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRGMA1A4Y4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRGMA1A4Y4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRGMA1A4Y4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRGMA1A4Y4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRGMA1A4Y4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRGMA1A4Y4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRGMA1A4Y4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRGMA1A4Y4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRGMA1A4Y4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRGMA1A4Y4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRGMA1A4Y4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRGMA1A4Y4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRGMA1A4Y4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRGMA1A4Y4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRGMA1A4Y4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRGMA1A4Y4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRGMA1A4Y4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRGMA1A4Y4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRGMA1A4Y4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRGMA1A4Y4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRGMA1A4Y4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRGMA1A4Y4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRGMA1A4Y4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRGMA1A4Y4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IRGMA1A4Y4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRGMA1A4Y4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRGMA1A4Y4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IRGMA1A4Y4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRGMA1A4Y4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRGMA1A4Y4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRGMA1A4Y4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRGMA1A4Y4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRGMA1A4Y4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRGMA1A4Y4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms