Protein–RNA interactions for Protein: A0A0X1KG70

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0X1KG70 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0X1KG70 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0X1KG70 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0X1KG70 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0X1KG70 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0X1KG70 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0X1KG70 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0X1KG70 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0X1KG70 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0X1KG70 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0X1KG70 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0X1KG70 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0X1KG70 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0X1KG70 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0X1KG70 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A0X1KG70 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0X1KG70 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A0X1KG70 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0X1KG70 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A0X1KG70 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0X1KG70 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A0X1KG70 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0X1KG70 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0X1KG70 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A0X1KG70 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A0X1KG70 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A0X1KG70 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0X1KG70 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A0X1KG70 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A0X1KG70 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0X1KG70 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A0X1KG70 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A0X1KG70 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A0X1KG70 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A0X1KG70 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A0X1KG70 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0X1KG70 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0X1KG70 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0X1KG70 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0X1KG70 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A0X1KG70 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0X1KG70 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0X1KG70 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0X1KG70 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A0X1KG70 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0X1KG70 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0X1KG70 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0X1KG70 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0X1KG70 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0X1KG70 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0X1KG70 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0X1KG70 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0X1KG70 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0X1KG70 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0X1KG70 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0X1KG70 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0X1KG70 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0X1KG70 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0X1KG70 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0X1KG70 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0X1KG70 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0X1KG70 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0X1KG70 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0X1KG70 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0X1KG70 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0X1KG70 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0X1KG70 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0X1KG70 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0X1KG70 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0X1KG70 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0X1KG70 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0X1KG70 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0X1KG70 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0X1KG70 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0X1KG70 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0X1KG70 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0X1KG70 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0X1KG70 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0X1KG70 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0X1KG70 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0X1KG70 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0X1KG70 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0X1KG70 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0X1KG70 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0X1KG70 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0X1KG70 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0X1KG70 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0X1KG70 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0X1KG70 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0X1KG70 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A0X1KG70 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0X1KG70 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0X1KG70 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0X1KG70 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0X1KG70 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0X1KG70 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0X1KG70 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0X1KG70 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0X1KG70 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0X1KG70 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms