Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6U6

TRAV8-7, T-cell receptor alpha variable 8-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV8-7A0A075B6U6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAV8-7A0A075B6U6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAV8-7A0A075B6U6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAV8-7A0A075B6U6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAV8-7A0A075B6U6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAV8-7A0A075B6U6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAV8-7A0A075B6U6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAV8-7A0A075B6U6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAV8-7A0A075B6U6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAV8-7A0A075B6U6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAV8-7A0A075B6U6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAV8-7A0A075B6U6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAV8-7A0A075B6U6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAV8-7A0A075B6U6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAV8-7A0A075B6U6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAV8-7A0A075B6U6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAV8-7A0A075B6U6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAV8-7A0A075B6U6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAV8-7A0A075B6U6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAV8-7A0A075B6U6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAV8-7A0A075B6U6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAV8-7A0A075B6U6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAV8-7A0A075B6U6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAV8-7A0A075B6U6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAV8-7A0A075B6U6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAV8-7A0A075B6U6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAV8-7A0A075B6U6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAV8-7A0A075B6U6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAV8-7A0A075B6U6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAV8-7A0A075B6U6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAV8-7A0A075B6U6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAV8-7A0A075B6U6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAV8-7A0A075B6U6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAV8-7A0A075B6U6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAV8-7A0A075B6U6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAV8-7A0A075B6U6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAV8-7A0A075B6U6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAV8-7A0A075B6U6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAV8-7A0A075B6U6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAV8-7A0A075B6U6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAV8-7A0A075B6U6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAV8-7A0A075B6U6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAV8-7A0A075B6U6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAV8-7A0A075B6U6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAV8-7A0A075B6U6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAV8-7A0A075B6U6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAV8-7A0A075B6U6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAV8-7A0A075B6U6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAV8-7A0A075B6U6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAV8-7A0A075B6U6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAV8-7A0A075B6U6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAV8-7A0A075B6U6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAV8-7A0A075B6U6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAV8-7A0A075B6U6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAV8-7A0A075B6U6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAV8-7A0A075B6U6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAV8-7A0A075B6U6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAV8-7A0A075B6U6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAV8-7A0A075B6U6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAV8-7A0A075B6U6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAV8-7A0A075B6U6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAV8-7A0A075B6U6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAV8-7A0A075B6U6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAV8-7A0A075B6U6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAV8-7A0A075B6U6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAV8-7A0A075B6U6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAV8-7A0A075B6U6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAV8-7A0A075B6U6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAV8-7A0A075B6U6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAV8-7A0A075B6U6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAV8-7A0A075B6U6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAV8-7A0A075B6U6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAV8-7A0A075B6U6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAV8-7A0A075B6U6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAV8-7A0A075B6U6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAV8-7A0A075B6U6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAV8-7A0A075B6U6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAV8-7A0A075B6U6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAV8-7A0A075B6U6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAV8-7A0A075B6U6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAV8-7A0A075B6U6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAV8-7A0A075B6U6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAV8-7A0A075B6U6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAV8-7A0A075B6U6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAV8-7A0A075B6U6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAV8-7A0A075B6U6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAV8-7A0A075B6U6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAV8-7A0A075B6U6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAV8-7A0A075B6U6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAV8-7A0A075B6U6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAV8-7A0A075B6U6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAV8-7A0A075B6U6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAV8-7A0A075B6U6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAV8-7A0A075B6U6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAV8-7A0A075B6U6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAV8-7A0A075B6U6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAV8-7A0A075B6U6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAV8-7A0A075B6U6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAV8-7A0A075B6U6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAV8-7A0A075B6U6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms