Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF3AQ9Y2N7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HIF3AQ9Y2N7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF3AQ9Y2N7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF3AQ9Y2N7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF3AQ9Y2N7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF3AQ9Y2N7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF3AQ9Y2N7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF3AQ9Y2N7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF3AQ9Y2N7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF3AQ9Y2N7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF3AQ9Y2N7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF3AQ9Y2N7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms