Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTDSP1Q9GZU7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CTDSP1Q9GZU7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms