Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL7

WDR12, Ribosome biogenesis protein WDR12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR12Q9GZL7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
WDR12Q9GZL7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
WDR12Q9GZL7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms