Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEIL1Q96FI4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEIL1Q96FI4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms