Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ7

TM4SF19, Transmembrane 4 L6 family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF19Q96DZ7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TM4SF19Q96DZ7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TM4SF19Q96DZ7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms