Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUMO1P63165 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.3 ms