Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GYS2P54840 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GYS2P54840 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GYS2P54840 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GYS2P54840 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GYS2P54840 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GYS2P54840 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GYS2P54840 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GYS2P54840 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GYS2P54840 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GYS2P54840 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GYS2P54840 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GYS2P54840 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GYS2P54840 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GYS2P54840 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GYS2P54840 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GYS2P54840 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GYS2P54840 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GYS2P54840 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GYS2P54840 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GYS2P54840 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GYS2P54840 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GYS2P54840 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GYS2P54840 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GYS2P54840 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GYS2P54840 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GYS2P54840 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GYS2P54840 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GYS2P54840 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GYS2P54840 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GYS2P54840 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GYS2P54840 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GYS2P54840 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GYS2P54840 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GYS2P54840 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GYS2P54840 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GYS2P54840 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GYS2P54840 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GYS2P54840 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GYS2P54840 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GYS2P54840 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GYS2P54840 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GYS2P54840 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GYS2P54840 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GYS2P54840 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GYS2P54840 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GYS2P54840 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GYS2P54840 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GYS2P54840 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GYS2P54840 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GYS2P54840 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GYS2P54840 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GYS2P54840 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GYS2P54840 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GYS2P54840 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GYS2P54840 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GYS2P54840 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GYS2P54840 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GYS2P54840 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GYS2P54840 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GYS2P54840 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GYS2P54840 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GYS2P54840 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GYS2P54840 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GYS2P54840 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GYS2P54840 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GYS2P54840 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GYS2P54840 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GYS2P54840 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GYS2P54840 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GYS2P54840 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GYS2P54840 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GYS2P54840 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GYS2P54840 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GYS2P54840 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GYS2P54840 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GYS2P54840 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GYS2P54840 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GYS2P54840 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GYS2P54840 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GYS2P54840 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GYS2P54840 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GYS2P54840 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GYS2P54840 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GYS2P54840 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GYS2P54840 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GYS2P54840 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GYS2P54840 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GYS2P54840 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GYS2P54840 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GYS2P54840 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GYS2P54840 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GYS2P54840 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GYS2P54840 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GYS2P54840 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GYS2P54840 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GYS2P54840 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GYS2P54840 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GYS2P54840 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GYS2P54840 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms