Protein–RNA interactions for Protein: P49019

HCAR3, Hydroxycarboxylic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCAR3P49019 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCAR3P49019 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCAR3P49019 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCAR3P49019 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HCAR3P49019 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HCAR3P49019 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HCAR3P49019 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms