Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRCP08575 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRCP08575 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRCP08575 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRCP08575 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRCP08575 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRCP08575 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRCP08575 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRCP08575 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRCP08575 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRCP08575 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRCP08575 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRCP08575 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRCP08575 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRCP08575 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRCP08575 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRCP08575 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRCP08575 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRCP08575 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRCP08575 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRCP08575 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRCP08575 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
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