Protein–RNA interactions for Protein: O14576

DYNC1I1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I1O14576 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DYNC1I1O14576 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DYNC1I1O14576 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms