Protein–RNA interactions for Protein: O14576

DYNC1I1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I1O14576 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
DYNC1I1O14576 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
DYNC1I1O14576 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
DYNC1I1O14576 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
DYNC1I1O14576 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
DYNC1I1O14576 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
DYNC1I1O14576 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
DYNC1I1O14576 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
DYNC1I1O14576 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
DYNC1I1O14576 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
DYNC1I1O14576 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
DYNC1I1O14576 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
DYNC1I1O14576 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
DYNC1I1O14576 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
DYNC1I1O14576 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
DYNC1I1O14576 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
DYNC1I1O14576 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
DYNC1I1O14576 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
DYNC1I1O14576 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DYNC1I1O14576 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
DYNC1I1O14576 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
DYNC1I1O14576 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
DYNC1I1O14576 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
DYNC1I1O14576 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
DYNC1I1O14576 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
DYNC1I1O14576 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
DYNC1I1O14576 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
DYNC1I1O14576 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
DYNC1I1O14576 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
DYNC1I1O14576 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
DYNC1I1O14576 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DYNC1I1O14576 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
DYNC1I1O14576 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
DYNC1I1O14576 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
DYNC1I1O14576 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
DYNC1I1O14576 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
DYNC1I1O14576 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
DYNC1I1O14576 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
DYNC1I1O14576 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
DYNC1I1O14576 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
DYNC1I1O14576 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
DYNC1I1O14576 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
DYNC1I1O14576 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
DYNC1I1O14576 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
DYNC1I1O14576 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
DYNC1I1O14576 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
DYNC1I1O14576 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
DYNC1I1O14576 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
DYNC1I1O14576 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
DYNC1I1O14576 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
DYNC1I1O14576 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
DYNC1I1O14576 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DYNC1I1O14576 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DYNC1I1O14576 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
DYNC1I1O14576 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
DYNC1I1O14576 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
DYNC1I1O14576 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
DYNC1I1O14576 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
DYNC1I1O14576 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
DYNC1I1O14576 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DYNC1I1O14576 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
DYNC1I1O14576 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
DYNC1I1O14576 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
DYNC1I1O14576 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
DYNC1I1O14576 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DYNC1I1O14576 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
DYNC1I1O14576 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
DYNC1I1O14576 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DYNC1I1O14576 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
DYNC1I1O14576 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DYNC1I1O14576 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
DYNC1I1O14576 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
DYNC1I1O14576 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
DYNC1I1O14576 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
DYNC1I1O14576 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
DYNC1I1O14576 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
DYNC1I1O14576 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
DYNC1I1O14576 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
DYNC1I1O14576 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
DYNC1I1O14576 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
DYNC1I1O14576 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
DYNC1I1O14576 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
DYNC1I1O14576 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
DYNC1I1O14576 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
DYNC1I1O14576 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
DYNC1I1O14576 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
DYNC1I1O14576 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
DYNC1I1O14576 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
DYNC1I1O14576 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
DYNC1I1O14576 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
DYNC1I1O14576 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
DYNC1I1O14576 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
DYNC1I1O14576 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DYNC1I1O14576 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
DYNC1I1O14576 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
DYNC1I1O14576 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
DYNC1I1O14576 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
DYNC1I1O14576 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
DYNC1I1O14576 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
DYNC1I1O14576 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms