Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NOP53Q9NZM5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NOP53Q9NZM5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms