Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL5

CYP39A1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP39A1Q9NYL5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP39A1Q9NYL5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP39A1Q9NYL5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP39A1Q9NYL5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CYP39A1Q9NYL5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP39A1Q9NYL5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP39A1Q9NYL5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP39A1Q9NYL5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP39A1Q9NYL5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP39A1Q9NYL5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP39A1Q9NYL5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP39A1Q9NYL5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP39A1Q9NYL5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CYP39A1Q9NYL5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CYP39A1Q9NYL5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP39A1Q9NYL5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP39A1Q9NYL5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP39A1Q9NYL5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP39A1Q9NYL5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP39A1Q9NYL5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP39A1Q9NYL5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP39A1Q9NYL5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP39A1Q9NYL5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CYP39A1Q9NYL5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP39A1Q9NYL5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP39A1Q9NYL5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP39A1Q9NYL5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CYP39A1Q9NYL5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms