Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCND1Q9NSA2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KCND1Q9NSA2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCND1Q9NSA2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms