Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP1R9BQ96SB3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPP1R9BQ96SB3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms