Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARXQ96QS3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms