Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BHLHE22Q8NFJ8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHLHE22Q8NFJ8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms