Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM4P67936 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM4P67936 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM4P67936 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM4P67936 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM4P67936 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM4P67936 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM4P67936 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM4P67936 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM4P67936 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM4P67936 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM4P67936 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM4P67936 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM4P67936 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM4P67936 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM4P67936 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM4P67936 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPM4P67936 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM4P67936 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM4P67936 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM4P67936 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM4P67936 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM4P67936 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM4P67936 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM4P67936 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM4P67936 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM4P67936 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM4P67936 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM4P67936 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM4P67936 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM4P67936 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM4P67936 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM4P67936 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM4P67936 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM4P67936 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM4P67936 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM4P67936 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM4P67936 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM4P67936 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM4P67936 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM4P67936 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM4P67936 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM4P67936 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM4P67936 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM4P67936 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM4P67936 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM4P67936 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM4P67936 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM4P67936 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM4P67936 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM4P67936 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM4P67936 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM4P67936 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM4P67936 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM4P67936 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM4P67936 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM4P67936 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM4P67936 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM4P67936 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM4P67936 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM4P67936 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM4P67936 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM4P67936 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM4P67936 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM4P67936 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM4P67936 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM4P67936 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM4P67936 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM4P67936 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM4P67936 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM4P67936 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM4P67936 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM4P67936 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM4P67936 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM4P67936 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM4P67936 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM4P67936 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM4P67936 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM4P67936 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM4P67936 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM4P67936 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM4P67936 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM4P67936 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM4P67936 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM4P67936 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM4P67936 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM4P67936 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM4P67936 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM4P67936 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM4P67936 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM4P67936 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM4P67936 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM4P67936 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM4P67936 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM4P67936 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM4P67936 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM4P67936 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM4P67936 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM4P67936 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TPM4P67936 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms