Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD23AP54725 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD23AP54725 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms