Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 SEPT11-212ENST00000512575 587 ntTSL 42.97□□□□□ -1.931e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 CAP1-217ENST00000461993 856 ntTSL 22.62□□□□□ -1.991e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 COMMD3-213ENST00000483684 722 ntTSL 52.27□□□□□ -2.051e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 TXNL1-210ENST00000589931 466 ntTSL 32.23□□□□□ -2.051e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.081e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 ACAT1-204ENST00000526119 729 ntTSL 51.83□□□□□ -2.121e-6■■■■■ 30.7
SUB1P53999 UBR5-202ENST00000517465 1095 ntTSL 22.96□□□□□ -1.946e-7■■■■■ 30.6
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SUB1P53999 PSMB4-204ENST00000476467 2067 ntTSL 210.34□□□□□ -0.757e-7■■■■■ 30.6
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SUB1P53999 PSMB4-203ENST00000474100 755 ntTSL 55.56□□□□□ -1.527e-7■■■■■ 30.6
SUB1P53999 TIMM17A-201ENST00000367287 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.042e-16■■■■■ 30.5
SUB1P53999 TIMM17A-203ENST00000482943 2523 ntTSL 25.31□□□□□ -1.562e-16■■■■■ 30.5
SUB1P53999 TIMM17A-202ENST00000478378 821 ntTSL 34.68□□□□□ -1.662e-16■■■■■ 30.5
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SUB1P53999 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 30.4
SUB1P53999 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.388e-7■■■■■ 30.4
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SUB1P53999 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 30.4
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SUB1P53999 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 30.4
SUB1P53999 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.391e-6■■■■■ 30.4
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SUB1P53999 KARS-202ENST00000319410 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.254e-13■■■■■ 30.3
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SUB1P53999 SUCLG1-208ENST00000491123 1073 ntTSL 31.79□□□□□ -2.125e-7■■■■■ 30.3
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SUB1P53999 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.63e-8■■■■■ 30.1
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SUB1P53999 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.596e-8■■■■■ 30
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SUB1P53999 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.125e-14■■■■■ 30
SUB1P53999 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.915e-14■■■■■ 30
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SUB1P53999 SDHA-208ENST00000507522 644 ntTSL 59.33□□□□□ -0.923e-41■■■■■ 30
SUB1P53999 SDHA-209ENST00000509082 434 ntTSL 59.01□□□□□ -0.973e-41■■■■■ 30
SUB1P53999 SDHA-211ENST00000509564 630 ntTSL 39.01□□□□□ -0.973e-41■■■■■ 30
SUB1P53999 SDHA-219ENST00000515815 704 ntTSL 39.01□□□□□ -0.973e-41■■■■■ 30
SUB1P53999 SDHA-214ENST00000511810 3001 ntTSL 28.06□□□□□ -1.123e-41■■■■■ 30
SUB1P53999 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 29.9
SUB1P53999 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 29.9
SUB1P53999 SEPT11-208ENST00000506731 659 ntTSL 53.88□□□□□ -1.792e-6■■■■■ 29.9
SUB1P53999 SEPT11-214ENST00000513373 546 ntTSL 23.38□□□□□ -1.872e-6■■■■■ 29.9
SUB1P53999 SEPT11-202ENST00000502401 276 ntTSL 53.27□□□□□ -1.892e-6■■■■■ 29.9
SUB1P53999 SEPT11-215ENST00000513697 328 ntTSL 22.61□□□□□ -1.992e-6■■■■■ 29.9
SUB1P53999 EIF3D-201ENST00000216190 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.885e-7■■■■■ 29.9
SUB1P53999 EIF3D-203ENST00000405442 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.195e-7■■■■■ 29.9
SUB1P53999 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 29.9
SUB1P53999 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 29.9
SUB1P53999 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.435e-7■■■■■ 29.9
SUB1P53999 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.235e-7■■■■■ 29.9
SUB1P53999 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.775e-7■■■■■ 29.9
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