Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4AP40617 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARL4AP40617 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms