Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTRLP40313 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTRLP40313 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTRLP40313 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTRLP40313 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTRLP40313 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTRLP40313 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTRLP40313 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTRLP40313 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTRLP40313 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTRLP40313 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTRLP40313 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTRLP40313 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTRLP40313 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTRLP40313 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTRLP40313 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTRLP40313 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTRLP40313 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTRLP40313 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTRLP40313 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTRLP40313 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTRLP40313 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTRLP40313 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTRLP40313 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTRLP40313 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTRLP40313 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTRLP40313 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTRLP40313 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTRLP40313 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTRLP40313 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTRLP40313 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTRLP40313 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTRLP40313 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTRLP40313 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTRLP40313 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTRLP40313 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTRLP40313 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTRLP40313 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTRLP40313 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTRLP40313 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTRLP40313 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTRLP40313 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTRLP40313 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTRLP40313 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTRLP40313 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTRLP40313 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTRLP40313 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTRLP40313 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTRLP40313 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTRLP40313 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTRLP40313 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTRLP40313 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTRLP40313 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTRLP40313 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTRLP40313 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTRLP40313 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTRLP40313 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTRLP40313 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTRLP40313 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTRLP40313 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTRLP40313 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTRLP40313 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTRLP40313 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTRLP40313 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTRLP40313 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTRLP40313 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTRLP40313 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTRLP40313 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTRLP40313 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTRLP40313 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTRLP40313 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTRLP40313 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTRLP40313 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTRLP40313 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTRLP40313 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTRLP40313 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTRLP40313 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTRLP40313 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTRLP40313 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTRLP40313 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTRLP40313 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTRLP40313 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTRLP40313 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTRLP40313 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTRLP40313 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTRLP40313 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTRLP40313 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTRLP40313 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTRLP40313 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTRLP40313 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTRLP40313 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTRLP40313 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTRLP40313 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTRLP40313 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTRLP40313 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTRLP40313 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTRLP40313 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTRLP40313 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTRLP40313 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTRLP40313 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.5 ms