Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TGFBR1P36897 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TGFBR1P36897 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms