Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKCHP24723 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms