Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 HAND2-204ENST00000621866 1337 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 MESD-206ENST00000561312 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 BHLHE40-201ENST00000256495 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 KRI1-201ENST00000312962 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 LINC01532-202ENST00000591143 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 GLB1-203ENST00000399402 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 FERMT1-204ENST00000536936 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 C1RL-AS1-201ENST00000382215 2086 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 NBPF17P-201ENST00000401087 2119 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 PNP-201ENST00000361505 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 SNAI1-201ENST00000244050 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 BAIAP2-AS1-202ENST00000577066 4465 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 ACTG1-216ENST00000615544 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AK7-201ENST00000267584 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 RMND5B-210ENST00000515098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 PMEL-215ENST00000550464 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 ADCK1-202ENST00000341211 1972 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 MEOX1-203ENST00000393661 1206 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 HLA-DRA-202ENST00000395388 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PTPRJQ12913 LINC00189-201ENST00000420364 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PTPRJQ12913 LINC00664-203ENST00000599078 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PTPRJQ12913 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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PTPRJQ12913 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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PTPRJQ12913 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 NDST1-207ENST00000523767 3449 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 CFDP1-201ENST00000283882 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 HLA-DQB1-203ENST00000399082 1219 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AC006967.2-201ENST00000426169 432 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AL353803.1-201ENST00000439014 800 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AL669970.2-201ENST00000446184 280 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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