Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RMDN1Q96DB5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RMDN1Q96DB5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RMDN1Q96DB5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RMDN1Q96DB5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RMDN1Q96DB5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RMDN1Q96DB5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RMDN1Q96DB5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RMDN1Q96DB5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RMDN1Q96DB5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RMDN1Q96DB5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RMDN1Q96DB5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RMDN1Q96DB5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RMDN1Q96DB5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RMDN1Q96DB5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RMDN1Q96DB5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RMDN1Q96DB5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RMDN1Q96DB5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RMDN1Q96DB5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RMDN1Q96DB5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RMDN1Q96DB5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RMDN1Q96DB5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RMDN1Q96DB5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RMDN1Q96DB5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RMDN1Q96DB5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms