Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UTP4Q969X6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
UTP4Q969X6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms