Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMIM20Q8N5G0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SMIM20Q8N5G0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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