Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NIPBLQ6KC79 TCP1-211ENST00000539756 780 ntTSL 312.4□□□□□ -0.425e-6■■■□□ 15.4
NIPBLQ6KC79 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.465e-6■■■□□ 15.4
NIPBLQ6KC79 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.715e-6■■■□□ 15.4
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NIPBLQ6KC79 RPL4-202ENST00000561554 580 ntTSL 410.47□□□□□ -0.738e-20■■■□□ 15.4
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NIPBLQ6KC79 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.781e-11■■■□□ 15.4
NIPBLQ6KC79 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.861e-11■■■□□ 15.4
NIPBLQ6KC79 CNOT1-211ENST00000567188 7830 ntTSL 1 (best)3.35□□□□□ -1.871e-11■■■□□ 15.4
NIPBLQ6KC79 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.04□□□□□ -2.081e-11■■■□□ 15.4
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NIPBLQ6KC79 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.665e-6■■■□□ 15.3
NIPBLQ6KC79 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.588e-7■■■□□ 15.3
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NIPBLQ6KC79 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.288e-7■■■□□ 15.3
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NIPBLQ6KC79 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.988e-7■■■□□ 15.3
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NIPBLQ6KC79 UNKL-207ENST00000403703 4281 ntTSL 1 (best)8.58□□□□□ -1.048e-7■■■□□ 15.3
NIPBLQ6KC79 DENND5A-210ENST00000530044 4060 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.088e-7■■■□□ 15.3
NIPBLQ6KC79 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.088e-7■■■□□ 15.3
NIPBLQ6KC79 CAST-206ENST00000395812 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.097e-8■■■□□ 15.3
NIPBLQ6KC79 SH3GLB2-209ENST00000461811 4828 ntTSL 1 (best)8.21□□□□□ -1.18e-7■■■□□ 15.3
NIPBLQ6KC79 RBPJ-208ENST00000504907 1682 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.118e-7■■■□□ 15.3
NIPBLQ6KC79 RAB18-204ENST00000465772 985 ntTSL 28.01□□□□□ -1.138e-7■■■□□ 15.3
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NIPBLQ6KC79 MIER1-203ENST00000357692 4978 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.178e-7■■■□□ 15.3
NIPBLQ6KC79 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.188e-7■■■□□ 15.3
NIPBLQ6KC79 FAM117A-207ENST00000509347 572 ntTSL 47.56□□□□□ -1.28e-7■■■□□ 15.3
NIPBLQ6KC79 EMC3-AS1-204ENST00000430621 683 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.218e-7■■■□□ 15.3
NIPBLQ6KC79 CWC15-206ENST00000621358 1113 ntTSL 57.45□□□□□ -1.228e-7■■■□□ 15.3
NIPBLQ6KC79 FAM117A-203ENST00000503720 528 ntTSL 47.12□□□□□ -1.278e-7■■■□□ 15.3
NIPBLQ6KC79 CCDC136-214ENST00000494552 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)6.9□□□□□ -1.315e-6■■■□□ 15.3
NIPBLQ6KC79 RAB18-201ENST00000356940 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.338e-7■■■□□ 15.3
NIPBLQ6KC79 SEC62-207ENST00000480708 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.338e-7■■■□□ 15.3
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