Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZBED5Q49AG3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZBED5Q49AG3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZBED5Q49AG3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZBED5Q49AG3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZBED5Q49AG3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED5Q49AG3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED5Q49AG3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED5Q49AG3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED5Q49AG3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED5Q49AG3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED5Q49AG3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZBED5Q49AG3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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