Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VPS72Q15906 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS72Q15906 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms