Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PKP1Q13835 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PKP1Q13835 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKP1Q13835 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
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