Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE4CQ08493 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE4CQ08493 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms