Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP4P49662 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP4P49662 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP4P49662 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP4P49662 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP4P49662 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP4P49662 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP4P49662 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP4P49662 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP4P49662 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP4P49662 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP4P49662 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP4P49662 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP4P49662 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP4P49662 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP4P49662 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP4P49662 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP4P49662 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP4P49662 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP4P49662 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP4P49662 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP4P49662 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP4P49662 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP4P49662 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP4P49662 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP4P49662 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP4P49662 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP4P49662 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP4P49662 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP4P49662 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP4P49662 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP4P49662 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP4P49662 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP4P49662 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP4P49662 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP4P49662 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP4P49662 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP4P49662 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP4P49662 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP4P49662 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP4P49662 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP4P49662 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP4P49662 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP4P49662 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP4P49662 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP4P49662 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP4P49662 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP4P49662 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP4P49662 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP4P49662 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP4P49662 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP4P49662 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP4P49662 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP4P49662 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP4P49662 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP4P49662 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP4P49662 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP4P49662 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP4P49662 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP4P49662 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP4P49662 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP4P49662 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP4P49662 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP4P49662 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP4P49662 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP4P49662 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP4P49662 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP4P49662 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP4P49662 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP4P49662 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP4P49662 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP4P49662 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP4P49662 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP4P49662 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP4P49662 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP4P49662 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP4P49662 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP4P49662 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP4P49662 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CASP4P49662 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CASP4P49662 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP4P49662 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP4P49662 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP4P49662 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP4P49662 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP4P49662 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP4P49662 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP4P49662 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP4P49662 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP4P49662 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP4P49662 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP4P49662 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP4P49662 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP4P49662 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP4P49662 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP4P49662 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP4P49662 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASP4P49662 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP4P49662 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP4P49662 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms