Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOX11P35716 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOX11P35716 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOX11P35716 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOX11P35716 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOX11P35716 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SOX11P35716 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SOX11P35716 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOX11P35716 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOX11P35716 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOX11P35716 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOX11P35716 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SOX11P35716 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX11P35716 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX11P35716 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX11P35716 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX11P35716 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX11P35716 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX11P35716 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX11P35716 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX11P35716 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX11P35716 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX11P35716 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX11P35716 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SOX11P35716 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX11P35716 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX11P35716 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX11P35716 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX11P35716 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX11P35716 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX11P35716 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX11P35716 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX11P35716 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX11P35716 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX11P35716 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SOX11P35716 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX11P35716 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX11P35716 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX11P35716 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX11P35716 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX11P35716 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX11P35716 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX11P35716 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX11P35716 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX11P35716 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX11P35716 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SOX11P35716 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX11P35716 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX11P35716 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX11P35716 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX11P35716 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX11P35716 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX11P35716 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX11P35716 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX11P35716 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX11P35716 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX11P35716 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX11P35716 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX11P35716 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX11P35716 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX11P35716 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX11P35716 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SOX11P35716 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SOX11P35716 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX11P35716 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX11P35716 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX11P35716 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX11P35716 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX11P35716 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX11P35716 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX11P35716 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SOX11P35716 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOX11P35716 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SOX11P35716 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOX11P35716 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOX11P35716 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOX11P35716 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOX11P35716 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOX11P35716 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOX11P35716 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOX11P35716 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SOX11P35716 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOX11P35716 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOX11P35716 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SOX11P35716 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX11P35716 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX11P35716 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX11P35716 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX11P35716 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX11P35716 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX11P35716 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX11P35716 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX11P35716 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX11P35716 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX11P35716 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX11P35716 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX11P35716 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX11P35716 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX11P35716 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SOX11P35716 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms