Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACADSP16219 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACADSP16219 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACADSP16219 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACADSP16219 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACADSP16219 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACADSP16219 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACADSP16219 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACADSP16219 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACADSP16219 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSP16219 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSP16219 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSP16219 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSP16219 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSP16219 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSP16219 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSP16219 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSP16219 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSP16219 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSP16219 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSP16219 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSP16219 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSP16219 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSP16219 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSP16219 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSP16219 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSP16219 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSP16219 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSP16219 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSP16219 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSP16219 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSP16219 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACADSP16219 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACADSP16219 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACADSP16219 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACADSP16219 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSP16219 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSP16219 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSP16219 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSP16219 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSP16219 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSP16219 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSP16219 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSP16219 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSP16219 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSP16219 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSP16219 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSP16219 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSP16219 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSP16219 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSP16219 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSP16219 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSP16219 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSP16219 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSP16219 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSP16219 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSP16219 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSP16219 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSP16219 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSP16219 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSP16219 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSP16219 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSP16219 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSP16219 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSP16219 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSP16219 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSP16219 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSP16219 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSP16219 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSP16219 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSP16219 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSP16219 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSP16219 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSP16219 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSP16219 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSP16219 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSP16219 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSP16219 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSP16219 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSP16219 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSP16219 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSP16219 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSP16219 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSP16219 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSP16219 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSP16219 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSP16219 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSP16219 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSP16219 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSP16219 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSP16219 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSP16219 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSP16219 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSP16219 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSP16219 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ACADSP16219 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSP16219 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSP16219 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSP16219 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSP16219 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms