Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEBLO76041 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEBLO76041 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEBLO76041 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEBLO76041 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEBLO76041 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEBLO76041 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEBLO76041 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEBLO76041 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEBLO76041 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEBLO76041 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEBLO76041 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEBLO76041 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEBLO76041 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEBLO76041 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEBLO76041 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEBLO76041 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEBLO76041 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEBLO76041 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEBLO76041 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEBLO76041 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEBLO76041 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEBLO76041 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEBLO76041 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEBLO76041 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEBLO76041 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEBLO76041 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEBLO76041 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEBLO76041 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEBLO76041 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEBLO76041 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEBLO76041 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEBLO76041 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEBLO76041 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEBLO76041 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEBLO76041 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEBLO76041 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEBLO76041 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEBLO76041 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEBLO76041 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEBLO76041 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEBLO76041 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEBLO76041 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEBLO76041 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEBLO76041 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEBLO76041 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEBLO76041 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEBLO76041 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEBLO76041 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEBLO76041 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEBLO76041 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEBLO76041 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEBLO76041 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEBLO76041 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEBLO76041 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEBLO76041 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEBLO76041 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEBLO76041 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEBLO76041 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEBLO76041 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEBLO76041 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEBLO76041 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEBLO76041 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEBLO76041 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEBLO76041 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEBLO76041 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEBLO76041 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEBLO76041 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEBLO76041 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEBLO76041 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEBLO76041 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEBLO76041 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEBLO76041 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEBLO76041 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEBLO76041 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEBLO76041 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEBLO76041 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEBLO76041 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEBLO76041 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEBLO76041 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEBLO76041 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEBLO76041 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEBLO76041 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEBLO76041 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEBLO76041 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEBLO76041 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEBLO76041 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEBLO76041 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEBLO76041 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEBLO76041 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEBLO76041 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEBLO76041 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEBLO76041 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEBLO76041 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEBLO76041 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEBLO76041 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEBLO76041 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEBLO76041 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEBLO76041 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEBLO76041 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms