Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00587B1AMM8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms