Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GMNCA6NCL1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GMNCA6NCL1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GMNCA6NCL1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms