Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 MIF4GD-214ENST00000618645 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PTPRJQ12913 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 FCHO1-234ENST00000600676 3094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 TNFAIP3-209ENST00000619035 2267 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PTPRJQ12913 PDHA1-206ENST00000422285 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 TEF-202ENST00000406644 4386 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 CCDC32-214ENST00000561011 1577 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 ZNF274-201ENST00000326804 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PTPRJQ12913 TRAP1-212ENST00000575671 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 HPSE2-201ENST00000370546 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PTPRJQ12913 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PTPRJQ12913 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 TACR1-202ENST00000409848 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PTPRJQ12913 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 TMEM91-206ENST00000447302 721 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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PTPRJQ12913 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PTPRJQ12913 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 MEF2C-AS1-205ENST00000509179 388 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 NUP210P2-201ENST00000510577 282 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PTPRJQ12913 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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