Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 TSPAN6-201ENST00000373020 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 FBLN1-203ENST00000340923 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 RNF13-203ENST00000392894 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 LIMK1-201ENST00000336180 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 WASL-201ENST00000223023 4435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 BHLHE40-201ENST00000256495 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 DSCR3-201ENST00000309117 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 FCHO1-234ENST00000600676 3094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 GTF2IP20-203ENST00000634905 2966 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SNAP25-201ENST00000254976 2053 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 OPN1MW3-201ENST00000599405 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SLIT2-202ENST00000503823 5233 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SCN5A-202ENST00000333535 8456 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 VOPP1-206ENST00000428097 1671 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PCDHB15-201ENST00000231173 4017 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CHCHD10-204ENST00000520222 384 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 COG7-201ENST00000307149 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SCML1-204ENST00000398080 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 MSANTD4-201ENST00000301919 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ZNF766-202ENST00000593612 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 RABL2B-201ENST00000354869 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PPP4R3A-206ENST00000554943 3369 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SLC38A1-206ENST00000549049 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 GNG11-201ENST00000248564 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC126323.1-203ENST00000562306 2579 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 MICU1-202ENST00000398761 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 DLC1-210ENST00000512044 3758 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CDC25B-201ENST00000245960 3597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CCDC33-206ENST00000558821 1993 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 TSPEAR-204ENST00000614657 4027 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 PCDHA9-201ENST00000378122 6900 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 BIRC2-213ENST00000613397 4066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 SCAMP5-203ENST00000562212 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 SPATA13-205ENST00000409126 2111 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AGGF1-201ENST00000312916 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 ADAMTS20-201ENST00000389420 6076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 FCHSD1-201ENST00000435817 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 FBLN2-201ENST00000295760 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 LDLR-205ENST00000557933 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 ZNF630-206ENST00000442455 2829 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 MRPL55-207ENST00000366733 834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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