Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 SNHG8-203ENST00000602520 327 ntTSL 27.38□□□□□ -1.236e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 UBE4B-208ENST00000475795 871 ntTSL 57.14□□□□□ -1.276e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.346e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.346e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.346e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 STAMBP-208ENST00000478946 955 ntTSL 36.41□□□□□ -1.386e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NUP58-204ENST00000394327 1408 ntTSL 56.33□□□□□ -1.45e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.46e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.46e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.46e-11■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 XRCC5-207ENST00000471649 610 ntTSL 26.15□□□□□ -1.421e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 HERPUD1-217ENST00000569429 562 ntTSL 46.12□□□□□ -1.438e-10■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.446e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.471e-6■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.486e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 UBFD1-209ENST00000569919 739 ntTSL 55.67□□□□□ -1.56e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 AC068547.1-201ENST00000636024 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 55.59□□□□□ -1.518e-19■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 UBE4B-207ENST00000470736 827 ntTSL 55.39□□□□□ -1.556e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 XRCC5-206ENST00000460284 2962 ntTSL 1 (best)5.31□□□□□ -1.566e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 ARL5A-203ENST00000446896 1268 ntTSL 25.31□□□□□ -1.568e-19■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 HERPUD1-207ENST00000563781 774 ntTSL 35.25□□□□□ -1.578e-10■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 VAPA-207ENST00000583879 719 ntTSL 25.23□□□□□ -1.576e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.631e-6■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.636e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 SNHG8-204ENST00000602573 570 ntTSL 24.83□□□□□ -1.646e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.726e-11■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 SEC63-209ENST00000484803 724 ntTSL 24.31□□□□□ -1.726e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.746e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 ARHGEF12-208ENST00000529970 3786 ntTSL 24.03□□□□□ -1.761e-6■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PDXDC1-206ENST00000561930 568 ntTSL 43.97□□□□□ -1.776e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 SMC6-202ENST00000381272 1803 ntTSL 53.69□□□□□ -1.826e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 WTAP-204ENST00000494513 635 ntTSL 53.6□□□□□ -1.836e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 IGF2BP2-211ENST00000496495 472 ntTSL 23.4□□□□□ -1.876e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 SEC63-202ENST00000429168 647 ntTSL 53.1□□□□□ -1.916e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 EIF4G2-213ENST00000528839 702 ntTSL 52.93□□□□□ -1.944e-9■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 EIF4G2-229ENST00000534272 591 ntTSL 32.93□□□□□ -1.944e-9■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 ARHGAP11A-203ENST00000562481 620 ntTSL 32.84□□□□□ -1.956e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.976e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -26e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 UBA6-204ENST00000505673 812 ntTSL 52.57□□□□□ -26e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 HERPUD1-211ENST00000566550 511 ntTSL 22.48□□□□□ -2.018e-10■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 VAPA-208ENST00000584796 654 ntTSL 31.87□□□□□ -2.116e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 ARHGAP11A-206ENST00000564918 572 ntTSL 31.66□□□□□ -2.146e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 EIF4G2-204ENST00000525606 690 ntTSL 21.17□□□□□ -2.226e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 EIF4G2-222ENST00000532120 223 ntTSL 30.98□□□□□ -2.254e-9■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 ERBIN-215ENST00000511671 589 ntTSL 30.51□□□□□ -2.336e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.76e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 DNMT1-227ENST00000592342 636 ntTSL 321.06■□□□□ 0.962e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 DNMT1-216ENST00000588952 841 ntTSL 520.36■□□□□ 0.852e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NAT9-225ENST00000583834 1993 ntTSL 318.48■□□□□ 0.552e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.392e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.292e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PPFIA4-205ENST00000486360 4547 ntTSL 216.02■□□□□ 0.162e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 HGS-214ENST00000576087 548 ntTSL 415.95■□□□□ 0.142e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.022e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.072e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NAT9-215ENST00000581762 744 ntTSL 214.43□□□□□ -0.12e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NAT9-227ENST00000584022 1103 ntTSL 214.43□□□□□ -0.12e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.112e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 DNMT1-214ENST00000588118 973 ntTSL 513.94□□□□□ -0.182e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.272e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 DNMT1-211ENST00000586988 711 ntTSL 512.01□□□□□ -0.492e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.532e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NAT9-207ENST00000579218 583 ntTSL 511.16□□□□□ -0.622e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 DNMT1-222ENST00000590619 231 ntTSL 1 (best)6.13□□□□□ -1.432e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 DNMT1-226ENST00000592054 591 ntTSL 42.83□□□□□ -1.962e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 SMC6-206ENST00000446852 2460 ntTSL 1 (best)17.78■□□□□ 0.449e-20■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.149e-20■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 SMC6-207ENST00000448223 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.969e-20■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.79e-20■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.825e-12■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 SLC38A2-205ENST00000548236 865 ntTSL 22.25□□□□□ -2.055e-12■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 SLC38A2-211ENST00000552414 566 ntTSL 31.46□□□□□ -2.186e-21■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 SMC6-210ENST00000621152 500 ntTSL 320.55■□□□□ 0.889e-20■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 MRPL16-203ENST00000531802 557 ntTSL 216.78■□□□□ 0.288e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.18e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.098e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.228e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 RNF213-202ENST00000411702 6428 ntTSL 212.35□□□□□ -0.434e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 RPE-202ENST00000359429 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.678e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 XPR1-202ENST00000367590 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.678e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 RPE-214ENST00000452025 779 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.728e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 RPE-206ENST00000429921 2511 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.758e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 RPE-201ENST00000354506 3165 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.878e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 CEP44-204ENST00000457424 3290 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.948e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 SMC6-204ENST00000428868 544 ntTSL 49.05□□□□□ -0.969e-20■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 RPE-216ENST00000454822 2130 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.968e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 CEP44-202ENST00000396791 3824 ntTSL 1 (best)8.89□□□□□ -0.998e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 RPE-207ENST00000435437 858 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.998e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 RPE-213ENST00000445268 668 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.028e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 RPE-210ENST00000438204 796 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.028e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 MRPL16-204ENST00000534340 574 ntTSL 38.33□□□□□ -1.088e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 RPE-211ENST00000438265 668 ntTSL 38.29□□□□□ -1.088e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 RPE-204ENST00000411934 792 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.088e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 RPE-205ENST00000429907 925 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.158e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 RNF213-203ENST00000427003 3552 ntTSL 1 (best)7.65□□□□□ -1.183e-9■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 RPE-203ENST00000408981 737 ntTSL 57.42□□□□□ -1.228e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.378e-8■■■■■ 33.3
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