Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDUFAF3Q9BU61 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms