Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 SON-207ENST00000436227 5269 ntAPPRIS P1 TSL 57.69□□□□□ -1.187e-7■■■□□ 16.3
TRA2AQ13595 EIF5-207ENST00000558800 552 ntTSL 24□□□□□ -1.771e-7■■■□□ 16.3
TRA2AQ13595 TNRC6A-209ENST00000562829 277 ntTSL 216.62■□□□□ 0.255e-15■■■□□ 16.3
TRA2AQ13595 TNRC6A-211ENST00000566108 454 ntTSL 312.83□□□□□ -0.365e-15■■■□□ 16.3
TRA2AQ13595 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.265e-15■■■□□ 16.3
TRA2AQ13595 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.365e-15■■■□□ 16.3
TRA2AQ13595 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.141e-7■■■□□ 16.2
TRA2AQ13595 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.11e-7■■■□□ 16.2
TRA2AQ13595 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.211e-7■■■□□ 16.2
TRA2AQ13595 NRBP1-205ENST00000419281 674 ntTSL 313.68□□□□□ -0.221e-7■■■□□ 16.2
TRA2AQ13595 NRBP1-202ENST00000356442 585 ntTSL 38.25□□□□□ -1.091e-7■■■□□ 16.2
TRA2AQ13595 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.12e-7■■■□□ 16.2
TRA2AQ13595 CALCOCO2-203ENST00000416445 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.92e-7■■■□□ 16.2
TRA2AQ13595 CALCOCO2-201ENST00000258947 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.142e-7■■■□□ 16.2
TRA2AQ13595 CALCOCO2-215ENST00000509507 1512 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.152e-7■■■□□ 16.2
TRA2AQ13595 CALCOCO2-221ENST00000513119 973 ntTSL 57.4□□□□□ -1.222e-7■■■□□ 16.2
TRA2AQ13595 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.472e-7■■■□□ 16.2
TRA2AQ13595 CALCOCO2-224ENST00000514962 765 ntTSL 25.48□□□□□ -1.532e-7■■■□□ 16.2
TRA2AQ13595 ZCCHC6-205ENST00000375960 4939 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.94e-6■■■□□ 16.2
TRA2AQ13595 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.514e-6■■■□□ 16.2
TRA2AQ13595 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.514e-6■■■□□ 16.2
TRA2AQ13595 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.961e-6■■■□□ 16.2
TRA2AQ13595 ANKRD11-214ENST00000568100 878 ntTSL 217.36■□□□□ 0.371e-6■■■□□ 16.2
TRA2AQ13595 TMEM107-205ENST00000449985 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.573e-48■■■□□ 16.2
TRA2AQ13595 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.34□□□□□ -2.363e-48■■■□□ 16.2
TRA2AQ13595 NR1H4-202ENST00000321046 1779 ntTSL 1 (best)12.9□□□□□ -0.343e-7■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.343e-7■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 NR1H4-207ENST00000549996 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.773e-7■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.363e-7■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.683e-7■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 RRBP1-205ENST00000398782 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 224.12■■□□□ 1.452e-9■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 BRD8-220ENST00000483805 543 ntTSL 28.44□□□□□ -1.065e-11■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.451e-15■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.541e-15■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 RC3H2-202ENST00000357244 3991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.731e-15■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 RC3H2-210ENST00000498479 5746 ntTSL 210.26□□□□□ -0.771e-15■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.811e-15■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.431e-15■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 ATP5I-203ENST00000506525 496 ntTSL 1 (best)13.78□□□□□ -0.27e-7■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 ATP5I-202ENST00000505852 300 ntTSL 29.89□□□□□ -0.837e-7■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 ATP5I-201ENST00000304312 365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.927e-7■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 ATP5I-205ENST00000515202 393 ntTSL 27.42□□□□□ -1.227e-7■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 ATP5I-204ENST00000515116 247 ntTSL 24.82□□□□□ -1.647e-7■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 PPIG-209ENST00000466142 735 ntTSL 22.74□□□□□ -1.972e-12■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 PDXDC1-207ENST00000562119 884 ntTSL 520.15■□□□□ 0.821e-6■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.71e-6■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.111e-6■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 PDXDC1-209ENST00000563667 554 ntTSL 414.64□□□□□ -0.071e-6■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.391e-6■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 PDXDC1-211ENST00000565362 720 ntTSL 510.67□□□□□ -0.71e-6■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 PDXDC1-217ENST00000570001 4828 ntTSL 210.51□□□□□ -0.731e-6■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 PDXDC1-202ENST00000396410 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.761e-6■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 PDXDC1-216ENST00000569715 3775 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.791e-6■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 PDXDC1-210ENST00000563679 2963 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -11e-6■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 PDXDC1-208ENST00000563522 556 ntTSL 48.21□□□□□ -1.11e-6■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 PDXDC1-203ENST00000450288 4171 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.221e-6■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 PDXDC1-215ENST00000567306 980 ntTSL 57.01□□□□□ -1.291e-6■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.331e-6■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 CEP152-202ENST00000380950 5635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.062e-6■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.492e-6■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.722e-6■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.812e-7■■■□□ 16.1
TRA2AQ13595 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.121e-7■■■□□ 16
TRA2AQ13595 AFMID-212ENST00000591256 631 ntTSL 412.28□□□□□ -0.441e-7■■■□□ 16
TRA2AQ13595 AFMID-209ENST00000589107 577 ntTSL 412.28□□□□□ -0.441e-7■■■□□ 16
TRA2AQ13595 AFMID-205ENST00000586731 550 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.511e-7■■■□□ 16
TRA2AQ13595 AFMID-210ENST00000589256 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.511e-7■■■□□ 16
TRA2AQ13595 AFMID-208ENST00000588800 647 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.631e-7■■■□□ 16
TRA2AQ13595 AFMID-204ENST00000586542 569 ntTSL 410.65□□□□□ -0.71e-7■■■□□ 16
TRA2AQ13595 AFMID-207ENST00000588199 778 ntTSL 510.65□□□□□ -0.71e-7■■■□□ 16
TRA2AQ13595 AFMID-202ENST00000409257 1730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.871e-7■■■□□ 16
TRA2AQ13595 AFMID-215ENST00000592988 1605 ntTSL 29.57□□□□□ -0.881e-7■■■□□ 16
TRA2AQ13595 AFMID-214ENST00000591952 582 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.931e-7■■■□□ 16
TRA2AQ13595 HP1BP3-209ENST00000437575 473 ntTSL 324.92■■□□□ 1.588e-37■■■□□ 16
TRA2AQ13595 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.718e-37■■■□□ 16
TRA2AQ13595 HP1BP3-206ENST00000419490 538 ntTSL 418.63■□□□□ 0.578e-37■■■□□ 16
TRA2AQ13595 HP1BP3-204ENST00000414993 727 ntTSL 415.75■□□□□ 0.118e-37■■■□□ 16
TRA2AQ13595 SDE2-201ENST00000272091 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.622e-6■■■□□ 16
TRA2AQ13595 SPTY2D1-201ENST00000336349 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.752e-6■■■□□ 16
TRA2AQ13595 HP1BP3-205ENST00000417710 572 ntTSL 59.28□□□□□ -0.928e-37■■■□□ 16
TRA2AQ13595 HP1BP3-212ENST00000487117 1598 ntTSL 25.42□□□□□ -1.548e-37■■■□□ 16
TRA2AQ13595 ANLN-210ENST00000457743 757 ntTSL 54.9□□□□□ -1.635e-9■■■□□ 16
TRA2AQ13595 KMT2A-203ENST00000420751 254 ntTSL 24.02□□□□□ -1.775e-9■■■□□ 16
TRA2AQ13595 QKI-214ENST00000544436 495 ntTSL 34.67□□□□□ -1.662e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.052e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.192e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.632e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 ODF2-206ENST00000393533 2086 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.742e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 ODF2-207ENST00000421776 1254 ntTSL 1 (best)9.96□□□□□ -0.822e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 ODF2-219ENST00000546203 2140 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.852e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 ODF2-203ENST00000372807 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.912e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 ODF2-210ENST00000444119 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.942e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 ODF2-201ENST00000351030 3899 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.952e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 ODF2-209ENST00000434106 3890 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.212e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 ODF2-220ENST00000604420 3030 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.232e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.462e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 SMARCA1-201ENST00000371121 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.84e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 SMARCA1-205ENST00000617310 4291 ntTSL 29.22□□□□□ -0.934e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 SMARCA1-202ENST00000371122 4099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.154e-6■■■□□ 15.9
TRA2AQ13595 SMARCA1-203ENST00000371123 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.164e-6■■■□□ 15.9
Retrieved 100 of 7,337 protein–RNA pairs in 97 ms