Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 SNX1-211ENST00000560829 1869 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.437e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 FBXO18-206ENST00000462507 906 ntTSL 212.29□□□□□ -0.441e-6■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.517e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.557e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.577e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 LRRC8D-206ENST00000527156 922 ntTSL 211.41□□□□□ -0.587e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.67e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 SNX1-204ENST00000559061 550 ntTSL 511.25□□□□□ -0.617e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 SMG6-206ENST00000570668 547 ntTSL 411.06□□□□□ -0.647e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 DPY30-207ENST00000452582 637 ntTSL 310.97□□□□□ -0.657e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 GCNT2-205ENST00000410107 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.677e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 LRRC8D-207ENST00000532201 597 ntTSL 410.85□□□□□ -0.677e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.77e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 CHID1-210ENST00000526714 976 ntTSL 510.45□□□□□ -0.747e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 TBC1D23-208ENST00000486274 4054 ntTSL 510.42□□□□□ -0.747e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 TOMM20-201ENST00000366607 3387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.757e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 GCNT2-214ENST00000489225 932 ntTSL 1 (best)10.19□□□□□ -0.787e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 FBXO18-202ENST00000379999 3702 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.841e-6■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 GGA2-214ENST00000569182 587 ntTSL 49.78□□□□□ -0.847e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 NME2-209ENST00000573262 789 ntTSL 1 (best)9.68□□□□□ -0.867e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 CHID1-213ENST00000528521 323 ntTSL 59.67□□□□□ -0.867e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 TTF1-203ENST00000612514 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.917e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 SNX1-202ENST00000380285 8119 ntTSL 1 (best)9.3□□□□□ -0.927e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 EP400-205ENST00000389562 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.957e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.957e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.957e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 KMT2E-206ENST00000474203 617 ntTSL 39.09□□□□□ -0.953e-6■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 FARP1-234ENST00000601361 457 ntTSL 29.08□□□□□ -0.967e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 LRRC8D-202ENST00000394593 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.027e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 SMG6-210ENST00000572205 551 ntTSL 48.56□□□□□ -1.047e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 GCNT2-212ENST00000485764 608 ntTSL 58.54□□□□□ -1.047e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 AMD1-201ENST00000368876 3040 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.048e-9■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 STXBP6-207ENST00000550887 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.087e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 STXBP6-204ENST00000546511 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.17e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 LRRC8D-203ENST00000414841 666 ntTSL 38.14□□□□□ -1.117e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 AMD1-202ENST00000368877 1605 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.118e-9■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 KPNA6-204ENST00000471599 3941 ntTSL 28□□□□□ -1.137e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 GCNT2-216ENST00000495262 2214 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.157e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 TTF1-201ENST00000334270 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.157e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.187e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 GCNT2-202ENST00000316170 4381 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.197e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 AC104109.4-201ENST00000520515 1744 ntTSL 27.39□□□□□ -1.237e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 FARP1-239ENST00000602171 518 ntTSL 57.28□□□□□ -1.247e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 GCNT2-206ENST00000459872 779 ntTSL 37.15□□□□□ -1.267e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 SMG6-205ENST00000570659 592 ntTSL 47.14□□□□□ -1.277e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 KPNA6-203ENST00000469790 879 ntTSL 27.11□□□□□ -1.277e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 PPP2CA-205ENST00000522385 585 ntTSL 37.1□□□□□ -1.277e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 GCNT2-207ENST00000461400 320 ntTSL 37.09□□□□□ -1.277e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.287e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 BRWD1-212ENST00000470108 1176 ntTSL 37.03□□□□□ -1.287e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 SMG6-209ENST00000571442 588 ntTSL 46.87□□□□□ -1.317e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.317e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.337e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 FARP1-241ENST00000602272 784 ntTSL 56.68□□□□□ -1.347e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 STXBP6-205ENST00000548182 3355 ntTSL 26.54□□□□□ -1.367e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 SMG6-204ENST00000570606 572 ntTSL 46.49□□□□□ -1.377e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.47e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.418e-9■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.447e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.457e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 SMG6-219ENST00000575663 574 ntTSL 35.93□□□□□ -1.467e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 FARP1-233ENST00000601133 612 ntTSL 55.81□□□□□ -1.487e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 AMD1-205ENST00000451850 3121 ntTSL 1 (best)5.63□□□□□ -1.518e-9■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 RFX7-203ENST00000560792 518 ntAPPRIS ALT2 TSL 45.53□□□□□ -1.522e-6■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 FARP1-223ENST00000598346 756 ntTSL 55.44□□□□□ -1.547e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.558e-9■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 GCNT2-204ENST00000397423 3528 ntTSL 1 (best)5.3□□□□□ -1.567e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 LRRC8D-204ENST00000441269 905 ntTSL 35.19□□□□□ -1.587e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.67e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 TRIB3-204ENST00000615226 877 ntTSL 35.03□□□□□ -1.67e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 SPPL3-205ENST00000540091 531 ntTSL 44.98□□□□□ -1.617e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 GCNT2-210ENST00000475577 547 ntTSL 44.34□□□□□ -1.717e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 GCNT2-208ENST00000474518 580 ntTSL 43.49□□□□□ -1.857e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 PPP2CA-206ENST00000523082 510 ntTSL 43.44□□□□□ -1.867e-7■■■■□ 23.2
ILF3Q12906 ENOSF1-215ENST00000583771 436 ntTSL 522.9■■□□□ 1.263e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 ENOSF1-218ENST00000584453 1230 ntTSL 522.89■■□□□ 1.253e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 ENOSF1-210ENST00000581332 451 ntTSL 420.89■□□□□ 0.934e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.733e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 ENOSF1-206ENST00000578651 1177 ntTSL 217.89■□□□□ 0.453e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 ENOSF1-211ENST00000581475 1745 ntTSL 1 (best)17.83■□□□□ 0.443e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.233e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.033e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 ENOSF1-207ENST00000579053 1313 ntTSL 513.25□□□□□ -0.295e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 ENOSF1-222ENST00000585128 1296 ntTSL 513.12□□□□□ -0.313e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 ENOSF1-208ENST00000580605 699 ntTSL 312.94□□□□□ -0.343e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.573e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 ENOSF1-221ENST00000585004 1501 ntTSL 29.93□□□□□ -0.823e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.485e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.25e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 XIST-211ENST00000635841 1734 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.033e-8■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.255e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.818e-9■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 DHRS3-201ENST00000430996 826 ntTSL 318.64■□□□□ 0.577e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.047e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 DTD1-203ENST00000618693 695 ntTSL 513.73□□□□□ -0.218e-9■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.157e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 SLC41A1-202ENST00000468057 3777 ntTSL 27.38□□□□□ -1.237e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.627e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.177e-7■■■■□ 23.1
ILF3Q12906 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.317e-7■■■■□ 23.1
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