Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP2P53365 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms