Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TSPAN13O95857 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN13O95857 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN13O95857 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN13O95857 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN13O95857 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN13O95857 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN13O95857 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN13O95857 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSPAN13O95857 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN13O95857 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN13O95857 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN13O95857 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN13O95857 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN13O95857 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN13O95857 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN13O95857 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN13O95857 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN13O95857 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN13O95857 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN13O95857 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN13O95857 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN13O95857 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN13O95857 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN13O95857 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN13O95857 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN13O95857 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN13O95857 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN13O95857 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN13O95857 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN13O95857 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN13O95857 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TSPAN13O95857 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN13O95857 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN13O95857 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN13O95857 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN13O95857 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN13O95857 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN13O95857 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN13O95857 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN13O95857 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN13O95857 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN13O95857 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN13O95857 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN13O95857 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN13O95857 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN13O95857 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN13O95857 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN13O95857 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN13O95857 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN13O95857 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN13O95857 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN13O95857 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN13O95857 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN13O95857 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN13O95857 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TSPAN13O95857 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSPAN13O95857 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSPAN13O95857 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TSPAN13O95857 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TSPAN13O95857 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TSPAN13O95857 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms